當地時間16日上午9點多，日本政府召開臨時內閣會議并匯總了閣僚的辭職信，安倍內閣全體辭職。16日下午，在眾參兩院的全體會議上將舉行首相指名選舉，自民黨總裁菅義偉將被選為第99任日本首相，并預計于當天成立菅義偉內閣。

　　16日，菅義偉將在首相官邸與公明黨代表山口那津男舉行黨首會談后，設立組閣本部，進行內閣人事變動，新任官房長官將發表內閣成員名單。然后經過在皇居的親任儀式和閣僚的認證儀式，16日晚，菅義偉內閣將正式成立。菅義偉在就任首相后將召開記者會，就內閣人事安排的目的和今后政權的運營等問題表明自己的想法。